Nacido en Ybytymi.
Pertenecía a un grupo de Sargentos que fueron promovidos a oficiales por el Mariscal López luego del retorno de las fuerzas del sur que estaban al mando del General Robles en el segundo semestre de 1865.
Siendo Capitán, el 22 de setiembre de 1866, fue asistente del General Díaz en la batalla de Curupayty.
Fue héroe de Isla Poí, comandando el Regimiento 19.
En ese mismo regimiento, fue electo por sus habilidades como nadador para la misión del 2 de marzo de 1868, el abordaje a los acorazados brasileros que quedaron entre Humaitá y Curupayty.
Participó en la batalla de Picada Diarte, el 8 de junio de 1869, que constituye el último triunfo de las armas paraguayas en la epopeya. Ahí fue su comandante Bernardino Caballero.
Cayó como prisionero en agosto de 1869 en Caraguatay.
En la posguerra se lo encontró combatiendo a lado de Bernardino Caballero y Patricio Escobar en las revoluciones de 1873, en las que fueron derrotados por fuerzas gubernistas.
Fue Jefe Político de su ciudad natal hasta que las disputas políticas de la época lo llevaron a unirse al Centro Democrático.
En 1891, sectores de ese partido consideraron que había llegado el momento de tomar el poder sacando del medio al colorado Juan Gualberto González, por lo que se programó un golpe de Estado cuyo jefe militar fue Eduardo Vera y como jefe político Antonio Taboada
El 18 de octubre de 1891, durante la toma de los cuarteles principales en la zona del Cabildo, entre los que se encontraba el de Caballería o Escolta, situado entre 14 de Mayo y El Paraguayo Independiente, Eduardo Vera fue herido de muerte por sus propios hombres por accidente cuando salía a recibirlos en la entrada del reducto.
Uno de sus hombres corrió a auxiliarlo, pero Vera se desangraba con rapidez y pronunciaba frases incoherentes: “Eduvigis, resiste Eduvigis”.
Al parecer Vera se acordaba de José Eduvigis Díaz, bajo cuyas órdenes combatiera durante la Guerra Grande.
El levantamiento fue controlado por las fuerzas del estado.
